Ponad dwa lata temu (kwiecień 2023) Piotr Nowakowski nabawił się poważnej kontuzji barku. Występując wówczas w PGE Projekcie Warszawa w meczu z ZAKSĄ Kędzierzyn-Koźle środkowy upadł na ziemie i wypadł z rywalizacji na dłuższy czas. Początkowo miał on wrócić na przełomie lutego i marca 2024 roku. - Mój bark przeżył już wiele perypetii w trakcie przygody z siatkówką. Kwestią czasu było, gdy zacznie się upominać o siebie. Niestety, przyszedł taki moment. Muszę o niego zadbać - mówił w październiku 2023 roku w rozmowie z TVP Sport. Finalnie data powrotu na boisko przedłużyła się o dobre kilka miesięcy. Wraz z końcem sezonu 2023/2024 po pięciu latach pobytu w Warszawie pożegnał się z PGE Projektem, a od lipca 2024 roku współpracował z Treflem, gdzie dochodził do pełnej sprawności. W tym pomagał mu trener przygotowania fizycznego Wojciech Bańbuła oraz fizjoterapeuta Piotr Ślugajski. Co, więcej w trakcie minionej kampanii wrócił do treningów na hali z drużyną z Gdańska. Nowakowski wraca do gry. Trefl ogłosił to oficjalnie W piątek klub PlusLigi oficjalnie poinformował podpisaniu kontraktu z 37-latkiem. Jak przyznał sam zainteresowany, nie może się doczekać powrotu na boisko i występu przed publicznością. - Nie mogę doczekać się pierwszego meczu w ERGO ARENIE i tej wyjątkowej atmosfery, którą tworzą gdańscy kibice. Chcę znów poczuć emocje z perspektywy boiska i to będzie dla mnie ogromną motywacją - powiedział. Nowakowski grał w tym klubie w latach 2017-2019. Podczas tamtych dwóch sezonów w Gdańsku wywalczył Puchar Polski czy brązowy medal mistrzostw Polski.