Napastnik jest związany z Amrą Silajdžić, modelką i aktorką. Para ślub wzięła w 2014 roku. W lutym 2016 roku urodziło się ich pierwsze dziecko - córeczka Una, a we wrześniu rok później na świat przyszedł synek Dani.Dzisiaj Edin Dżeko poinformował, że urodziła się Dalia."Witamy na świecie nasz kwiatuszek" - napisał piłkarz na portalu społecznościowym.