Głównym zadaniem 62-letniego Pekermana będzie doprowadzić Kolumbię do finałów piłkarskich mistrzostw świata, których gospodarzem będzie w 2014 roku Brazylia. Argentyńczyk zastąpił na stanowisku selekcjonera byłego reprezentanta Kolumbii Leonela Alvareza. Ten ostatni zaś zmienił Hernana Dario Gomeza, który ustąpił po tak zwanej "aferze restauracyjnej", w której wdał się w wymianę niezbyt cenzuralnych słów z jedną z obecnych w lokalu fanek reprezentacji. Jose Nestor Pekerman zdobył trenerską sławę szkoląc piłkarską młodzież. Reprezentacja Argentyny pod jego wodzą trzykrotnie wygrała w latach 1995, 1997 i 2001 mistrzostwa świata zawodników do lat 20. W 2004 roku objął reprezentację kraju seniorów. W Mundialu w Niemczech w 2006 roku Argentyna przegrała w ćwierćfinale, po karnych, z gospodarzami turnieju, a on stracił pracę.