Największe sukcesy 55-letni trener odniósł w latach 2000-01 kiedy z Valencią dwukrotnie dotarł do finału Ligi Mistrzów. Za pierwszym razem jego drużyna uległa Realowi Madryt 0:3, a w następnym finale Bayernowi Monachium po rzutach karnych. Kolejne dwa lata Cuper spędził w Mediolanie. Z Interem zdołał jednak wywalczyć tylko wicemistrzostwo Włoch. Następne miejsca pracy były już znacznie mniej prestiżowe - Mallorca, Betis Sevilla, Parma, reprezentacja Gruzji, Aris.