Legia Warszawa zmierzy się ze zwycięzcą pary Sileks Kratovo (Macedonia) - Drita Gnjilane FC (Kosowo).Lech Poznań może zagrać ze zwycięzcą pary OFI Kreta (Grecja) - Apollon Limassol (Cypr). Piast Gliwice może zagrać ze zwycięzca pary IFK Goeteborg (Szwecja) - FC Kopenhaga (Dania).Pewna udziału w tej fazie rywalizacji jest tylko Legia. Stołeczny zespół odpadł z batalii o fazę grupową Ligi Mistrzów i do trzeciej rundy kwalifikacji LE trafia z automatu. Aby się w niej znaleźć, Lech i Piast muszą uporać się z rywalami w rundzie drugiej. Ich przeciwnikami na tym etapie będą odpowiednio - szwedzki Hammarby IF (16.09, mecz wyjazdowy) i austriacki TSV Hartberg (17.09, u siebie). Z areną międzynarodową pożegnał się już czwarty z naszych pucharowiczów - Cracovia. Zdobywca Pucharu Polski w 1. rundzie eliminacyjnej LE przegrał w gościnie z Malmoe FF 0-2. Mecze 3. rundy eliminacji LE rozegrane zostaną 24 września. O losach awansu zadecyduje tylko jeden mecz. W fazie grupowej LE wystąpią zwycięzcy 4. rundy. Finał bieżącej edycji zostanie rozegrany 26 maja 2021 roku na Stadionie Energa Gdańsk.