Badia został trenerem Lechii 21 marca 2023 roku. Zastąpił na tym stanowisku Marcina Kaczmarka. Celem nadrzędnym postawionym przez pion sportowy było przede wszystkim utrzymanie drużyny w Ekstraklasie. Do tego jednak nie doszło, dlatego "klub nie zdecydował się na kontynuowanie współpracy". Lechia w tym sezonie grała w eliminacjach europejskich pucharów, a zakończyła go spadkiem z Ekstraklasy. W sumie prowadziło ją aż czterech trenerów. Zaczynał Tomasz Kaczmarek, potem przez chwilę zastępował go Maciej Kalkowski. Następnie stery przejął Marcin Kaczmarek i w końcu drużynę miał ratować Badia. Zamiast tego zakończyło się 17. miejscem w tabeli i ośmiopunktową stratą do pozycji gwarantującej utrzymanie. Lechia Gdańsk spadła z Ekstraklasy w atmosferze skandalu Poza tym zrobili to w atmosferze skandalu, ponieważ przez zachowanie swoich kibiców w Gliwicach ich mecz z Piastem został przerwany w 65. minucie. O wyniku zdecyduje komisja rozgrywek. Klub następnie zapowiedział surowe konsekwencje. "Klub Lechia Gdańsk S.A. stanowczo potępia zachowanie osób, które uniemożliwiły w dniu dzisiejszym dokończenie meczu ostatniej kolejki PKO BP Ekstraklasy z Piastem Gliwice. Spadek drużyny z ligi jest dla wszystkich ogromnym ciosem, jednak nie daje to nikomu prawa, aby dopuszczać się łamania zasad, odbierania ludziom przyjemności ze sportu oraz przede wszystkim narażania klubu na daleko idące konsekwencje finansowe oraz wizerunkowe, które mogą utrudnić mu misję szybkiego powrotu do najwyższej klasy rozgrywkowej w Polsce" - napisano w komunikacie