Rozdźwięk między FIBA-Europe i ULEB trwał od 2001 roku, gdy kluby zrzeszone w ULEB powołały do życia Euroligę. Na mocy porozumienia już w najbliższym sezonie dotychczasowy Puchar ULEB (obecne zaplecza Euroligi), zmieni nazwę na Puchar Europy. Powstanie także nowy puchar - EuroChallenge. W Pucharze Europy zagrają 32 drużyny z których 24, w tym wicemistrz Polski PGE Turów Zgorzelec, są już pewne udziału. Pozostałe osiem ekip otrzyma prawo gry po przebrnięciu dwustopniowych eliminacji. 32 zespoły Pucharu Europy podzielone zostaną na osiem grup. Mecze pierwszej fazy grupowej rozgrywane będą od 25 listopada 2008 do 13 stycznia 2009). Awans do drugiej fazy gier grupowych uzyska 16 ekip (zwycięzcy grup i wiceliderzy), które zostaną przydzielone do czterech grup. Osiem najlepszych zespołów awansuje do turnieju Final Four, a zwycięzca Pucharu ULEB 2009 roku wywalczy prawo gry w prestiżowej Eurolidze w sezonie 2009/2010. W rozgrywkach EuroChallenge w sezonie 2008/2009 wezmą udział 32 drużyny, a dwa najlepsze uzyskają awans do Pucharu Europy w sezonie 2009/2010.