Wcześniej z rywalizacji wycofał się również mający problemy zdrowotne Michał Kwiatkowski (Sky). Na piątym etapie, na którym kolarze mieli do pokonania 177,4 km z Ollon do Genewy, najlepszy z Polaków Paweł Poljański (Tinkoff) był 36. W klasyfikacji końcowej jest 20. Quintana utrzymał 19-sekundową przewagę nad Francuzem Thibautem Pinotem (FDJ). Trzecie miejsce zajął Hiszpan Jon Izagirre (Movistar). Wyniki 5. etapu, Ollon - Genewa (177,4 km): 1. Michael Albasini (Szwajcaria/Orica) 4:13.17 2. Andrey Amador (Kostaryka/Movistar) 3. Wilco Kelderman (Holandia/LottoNL) 4. Niccolo Bonifazio (Włochy/Trek) 5. Moreno Hofland (Holandia/LottoNL) 6. Kristian Sbaragli (Włochy/Dimension Data) ... 36. Paweł Poljański (Polska/Tinkoff) 72. Tomasz Marczyński (Polska/Lotto Soudal) wszyscy ten sam czas 117. Łukasz Wiśniowski (Polska/Etixx-Quick Step) strata 11.49 Klasyfikacja końcowa: 1. Nairo Quintana (Kolumbia/Movistar) 16:20.20 2. Thibaut Pinot (Francja/FDJ) strata 19 s 3. Jon Izagirre (Hiszpania/Movistar) 23 3. Ilnur Zakarin (Rosja/Katiusza) 26 5. Tom Dumoulin (Holandia/Giant) 57 6. Rui Costa (Portugalia/Lampre) 1.12 ... 20. Paweł Poljański (Polska/Tinkoff) 5.59 66. Tomasz Marczyński (Polska/Lotto Soudal) 38.28 116. Łukasz Wiśniowski (Polska/Etixx-Quick Step) 1:02.12