Liczący 798 kilometrów trzeci etap wygrał Francuz Stephane Peterhansel w Mini - trzynastokrotny zwycięzca Rajdu Dakar (siedem razy za kierownicą samochodu i sześć razy na motocyklu). Przygoński, który po raz kolejny startuje z belgijskim pilotem Tomem Colsoulem, stracił prawie 12 minut - 11.47. Drugi na mecie w środę Katarczyk Nasser Al-Attiyah (Toyota) był wolniejszy od Peterhansela o 3.26, ale objął prowadzenie w klasyfikacji generalnej. Piąty w tym zestawieniu Przygoński traci do Al-Attiyaha 13.45. Ósma w środę załoga Aron Domżała, Maciej Marton przyjechała 33.16 za Peterhanselem, a w klasyfikacji generalnej jest dziewiąta (strata 42.56 do lidera). Dziesiąte miejsce tego dnia zajął litewski kierowca Benediktas Vanagas, jadący z Sebastianem Rozwadowskim (Toyota) - 39.24 straty. Dopiero jedenasty był słynny Francuz Sebastien Loeb (Peugeot), 42.55 za Peterhanselem. Dzień wcześniej dziewięciokrotny rajdowy mistrz świata wygrał etap. Jeszcze gorsza jest sytuacja innego z byłych rajdowych mistrzów świata Hiszpana Carlosa Sainza (Mini), który uszkodził przednie zawieszenie i utknął na prawie godzinę. Bardzo duże problemy miał też prowadzący po dwóch etapach Giniel De Villiers z RPA (Toyota). Do istotnych zmian doszło w rywalizacji motocyklistów. Prowadzący po dwóch etapach w klasyfikacji generalnej Hiszpan Joan Barreda (Honda) utknął na 143. kilometrze. Nie był w stanie kontynuować rywalizacji. Został zabrany przez helikopter, a następnie odtransportowany z powrotem do obozu w San Juan de Marcona. Barreda, który startuje w Rajdzie Dakar od 2011 roku, czterokrotnie nie ukończył tej imprezy, m.in. poprzedniej edycji. Jego najlepszym wynikiem było piąte miejsce w 2017 roku. Etap wygrał Francuz Xavier de Soultrait (Yamaha), a liderem klasyfikacji łącznej został finiszujący w środę tuż za nim Chilijczyk Pablo Quintanilla (Husqvarna). Polacy zajęli odległe miejsca. Adam Tomiczek był 43., a Maciej Giemza (obaj KTM) - 61. Na 12. pozycji wśród quadowców uplasował się Kamil Wiśniewski (Can-am). W klasyfikacji generalnej jest jedenasty - traci ponad dwie godziny (2:18.43) do lidera Argentyńczyka Nicolasa Cavigliasso (Yamaha). W rywalizacji ciężarówek druga po dwóch etapach była załoga Holendra Gerarda de Rooya (Iveco), w której mechanikiem jest Dariusz Rodewald, ale w środę poniosła duże straty. Zajęła dwunaste miejsce i w klasyfikacji generalnej spadła na siódme. Traci 1:17.25 do prowadzącej rosyjskiej ekipy Eduarda Nikołajewa w Kamazie. Wyniki 3. etapu San Juan de Marcona - Arequipa (798 km, w tym 331 km OS): samochody 1. Stephane Peterhansel (Francja/Mini) 3:54.31 2. Nasser Al-Attiyah (Katar/Toyota strata 3.26 3. Jakub Przygoński (Polska/Mini) 11.47 ... 8. Aron Domżała (Polska/Toyota) 33.16 klasyfikacja generalna 1. Al-Attiyah 8:34.08 2. Yazeed Al Rajhi (Arabia Saudyjska/Mini) 6.48 3. Peterhansel 7.03 ... 5. Przygoński 13.45 9. Domżała 42.56 motocykle 1. Xavier de Soultrait (Francja/Yamaha) 4:07.42 2. Pablo Quintanilla (Chile/Husqvarna) 0.15 3. Kevin Benavides (Argentyna/Honda) 2.37 ... 43. Adam Tomiczek (Polska/KTM) 1:26.33 61. Maciej Giemza (Polska/KTM) 1:55.18 klasyfikacja generalna 1. Quintanilla 8:34.28 2. Benavides 11.23 3. Sam Sunderland (W.Brytania/KTM) 12.12 .... 30. Tomiczek 2:05.54 39. Giemza 2:33.52