Trasa rajdu ma prawie 10 tysięcy kilometrów, w tym 5652 km stanowić będą odcinki specjalne. Trasa pierwszego etapu z Buenos Aires do Santa Rosa ma 733 km długości w tym 371 km odcinka specjalnego. Harmonogram 30. Rajdu Dakar: 1 etap (3 stycznia 2009): Buenos Aires - Santa Rosa (733 km; 371 km odcinek specjalny) 2 etap (4 stycznia): Santa Rosa - Puerto Madryn (837 km; 237 km odcinka specjalnego) 3 etap (5 stycznia): Puerto Madryn - Jacobacci (694 km; 551 km odcinka specjalnego) 4 etap (6 stycznia): Jacobacci - Neuquen (488 km; 459 km odcinka specjalnego) 5 etap (7 stycznia): Neuquen - San Rafael (763 km; 506 km odcinka specjalnego) 6 etap (8 stycznia): San Rafael - Mendoza (625 km; 395 km odcinka specjalnego) 7 etap (9 stycznia): Mendoza/Argentyna - Valparaiso/Chile (816 km; 419 km odcinka specjalnego) 10 stycznia (dzień przerwy): 8 etap (11 stycznia): Valparaiso - La Serena (652 km; 294 km odcinka specjalnego) 9 etap (12 stycznia): La Serana - Copiapo (537 km; 449 km odcinka specjalnego) 10 etap (13 stycznia): Copiapo - Copiapo (690 km; 670 km odcinka specjalnego) 11 etap (14 stycznia): Copiapo/Chile - Fiambala/Argentyna (680 km; 215 km odcinka specjalnego) 12 etap (15 stycznia): Fiambala - La Rioja (518 km; 253 km odcinka specjalnego) 13 etap (16 stycznia): La Rioja - Cordoba (753 km; 545 km odcinka specjalnego) 14 etap (17 stycznia): Cordoba - Buenos Aires (792 km; 227 km odcinka specjalnego - META).