Po 14 z nich sięgnął z Barceloną, w której pracował w latach 2008-12. Z klubem z Bawarii, którego piłkarzy szkoli od lipca 2013, wcześniej zdobył Superpuchar Europy i triumfował w klubowych mistrzostwach świata. Trofea trenera Josepa Guardioli: FC Barcelona (2008-12) - 14: Puchar Europy (Liga Mistrzów) - 2009, 2011 klubowe mistrzostwo świata - 2009, 2011 Superpuchar Europy - 2009, 2011 mistrzostwo Hiszpanii - 2009, 2010, 2011 Puchar Hiszpanii - 2009, 2012 Superpuchar Hiszpanii - 2009, 2010, 2011 Bayern Monachium (2013-?) - 3: klubowe mistrzostwo świata - 2013 Superpuchar Europy - 2013 mistrzostwo Niemiec - 2014