Podopieczna trenera Aleksandra Wierietielnego po raz pierwszy na podium pucharowych zawodów stanęła 7 stycznia 2006 roku w estońskim Otepaeae, kiedy była trzecia na 10 km techniką klasyczną. Pierwsze zwycięstwo odniosła rok później w tej samej miejscowości i konkurencji. Na 43 miejsca na podium składa się 14 triumfów, 13 drugich pozycji i 16 trzecich lokat. Justyna Kowalczyk na podium w zawodach narciarskiego PŚ: - 1. miejsce (14): - 27.01.2007 - Otepaeae (Estonia) - 10 km techniką klasyczną 22.01.2008 - Canmore (Kanada) - bieg łączony (7,5 km techniką klasyczną+7,5 km techniką dowolną) 17.01.2009 - Whistler (Kanada) - bieg łączony (7,5 km techniką klasyczną+7,5 km techniką dowolną) 24.01.2009 - Otepaeae (Estonia) - 10 km techniką klasyczną 14.02.2009 - Valdidendro (Włochy) - 10 km techniką klasyczną 08.03.2009 - Lahti (Finlandia) - 10 km techniką dowolną 28.11.2009 - Kuusamo (Finlandia) - sprint 1,2 km techniką klasyczną 20.12.2009 - Rogla (Słowenia) - 15 km techniką klasyczną 2.01.2010 - Oberhof (Niemcy) - 10 km na dochodzenie techniką klasyczną 7.01.2010 - Dobbiaco (Włochy) - 5 km techniką klasyczną 16.01.2010 - Otepaeae (Estonia) - 10 km techniką klasyczną 23.01.2010 - Rybińsk (Rosja) - bieg łączony 2x7,5 km techniką klasyczną i dowolną 6.02.2010 - Canmore (Kanada) - sprint 1,4 km techniką klasyczną 19.03.2010 - Falun (Szwecja) - 2,5 km techniką klasyczną - 2. miejsce (13): - 16.02.2008 - Liberec (Czechy) - 8,7 km techniką dowolną 15.03.2008 - Bormio (Włochy) - 10 km techniką klasyczną 16.03.2008 - Bormio (Włochy) - 10 km techniką dowolną 16.01.2009 - Whistler (Kanada)- sprint 1,3 km techniką klasyczną 14.03.2009 - Trondheim (Norwegia) - 30 km techniką klasyczną 19.12.2009 - Rogla (Słowenia) - sprint 1,4 km techniką klasyczną 3.01.2010 - Oberhof (Niemcy) - sprint 1,6 km techniką klasyczną 5.02.2010 - Canmore (Kanada) - 10 km techniką dowolną 6.03.2010 - Lahti (Finlandia) - bieg łączony 2x7,5 km techniką klasyczną i dowolną 17.03.2010 - Sztokholm (Szwecja) - sprint 1,040 km techniką klasyczną 27.11.2010 - Kuusamo (Finlandia) - 5 km techniką klasyczną 11.12.2010 - Davos (Szwajcaria) - 10 km techniką klasyczną 18.12.2010 - La Clusaz (Francja) - 15 km techniką dowolną - 3. miejsce (16): - 7.01.2006 - Otepaeae (Estonia) - 10 km techniką klasyczną 2.12.2007 - Kuusamo (Finlandia) - 10 km techniką klasyczną 28.12.2007 - Nove Mesto (Czechy) - sprint 3,3 km techniką klasyczną 4.01.2008 - Asiago (Włochy) - sprint 1,2 km techniką dowolną 23.01.2008 - Canmore (Kanada) - sprint 1,2 km techniką klasyczną 25.01.2008 - Canmore (Kanada) - 10 km techniką dowolną 29.11.2008 - Kuusamo (Finlandia) - sprint 1,2 km techniką klasyczną 27.12.2008 - Oberhof (Niemcy) - sprint 2,8 km technika dowolną 28.12.2008 - Oberhof (Niemcy) - 10 km techniką klasyczną 12.03.2009 - Trondheim (Norwegia) - sprint 1,4 km techniką klasyczną 20.03.2009 - Falun (Szwecja) - 2,5 km techniką dowolną 21.03.2009 - Falun (Szwecja) - bieg łączony (5 km techniką klasyczną + 5 km techniką dowolną) 1.01.2010 - Oberhof (Niemcy) - 2,8 km techniką dowolną 5.01.2010 - Dobbiaco (Włochy) - 16 km na dochodzenie techniką dowolną 21.01.2010 - Rybińsk (Rosja) - sprint 1,3 km techniką dowolną 28.11.2010 - Kuusamo (Finlandia) - 10 km techniką dowolną