W poniedziałek na ucieczkę zdecydował się aktualny mistrz świata Włoch Paolo Bettini, który doścignął Hiszpana Manuela Ortegę. Ich akcja zakończyła się niepowodzeniem, podobnie jak próba Francuzów Davida Moncoutie i Sylvaina Chavanela. Finisz był popisem Boonena, który powetował sobie... odebranie prawa jazdy. W Belgii ukarano go w ten sposób za brawurową jazdę samochodem po pijanemu. Boonen wyprzedził Bennatiego, a trzeci linię mety minął 38-letni weteran z Niemiec Erik Zabel. Wyniki 3. etapu, Jaen - Kordowa (168,6 km): 1. Tom Boonen (Belgia/Quick Step) - 4:25.24 2. Daniele Bennati (Włochy/Liquigas) 3. Erik Zabel (Niemcy/Milram) 4. Koldo Fernandez (Hiszpania/Euskaltel) 5. Nicolas Roche (Francja/Credit Agricole) 6. Greg van Avermaet (Belgia/Silence) 7. Leonardo Duque (Kolumbia/Cofidis) 8. Sebastien Hinault (Francja/Credit Agricole) 9. Tom Stamsnijder (Holandia/Gerolsteiner) 10. Lloyd Mondory (Francja/AG2R) ten sam czas klasyfikacja generalna: 1. Daniele Bennati (Włochy/Liquigas) - 8:56.27 2. Alejandro Valverde (Hiszpania/Caisse d'Epargne) strata 7 s 3. Tom Boonen (Belgia/Quick Step) 10 4. Filippo Pozzato (Włochy/Liquigas) 20 5. Egoi Martinez (Hiszpania/Euskaltel) 22 6. Davide Rebellin (Włochy/Gerolsteiner) 26 7. Inigo Landaluze (Hiszpania/Euskaltel) 26 8. Erik Zabel (Niemcy/Milram) 27 9. Mauricio Ardila (Kolumbia/Rabobank) 27 10. Igor Anton (Hiszpania/Euskaltel) 28