Drugoligowcy z ostatniego sezonu włączą się do rywalizacji od 1/32 finału (27 sierpnia), a pierwszoligowcy od 1/16 finału (24 września). Terminy Remes Pucharu Polski sezonu 2008/2009: 30.07.08 - 1. runda wstępna 13.08.08 - 2. runda wstępna 27.08.08 - 1/32 finału (z udziałem 18 drugoligowców z sezonu 2007/08) 24.09.08 - 1/16 finału (z udziałem 16 pierwszoligowców z sezonu 2007/08) 29.10.08 - 1/8 finału 19.03.09 - pierwsze mecze 1/4 finału 7.04.09 - rewanżowe mecze 1/4 finału 29.04.09 - pierwsze mecze 1/2 finału 6.05.09 - rewanżowe mecze 1/2 finału