Frankowski jest wychowankiem Jagiellonii, z zespołem tym wywalczył mistrzostwo Polski juniorów. Potem wyjechał do Francji, gdzie spędził cztery lata a w 1998 roku został zawodnikiem Wisły. W Krakowskim klubie grał do 2005 roku, a potem wyjechał zagranicę. Ostatni rok spędził w Chicago Fire.