45-letni Thon (karierę zakończył w 2002 roku) przez prawie półtora roku był szkoleniowcem amatorskiej drużyny, z siedzibą w 90-tysięcznym mieście Marl (Nadrenia Północna-Westfalia). Powodem zakończenia pracy był konflikt ze starszymi zawodnikami. To była pierwsze doświadczenie trenerskie w karierze dawnego piłkarza Schalke 04 Gelsenkirchen i Bayernu Monachium. Jego zespół zajmuje dziesiąte miejsce po pięciu kolejkach V ligi (NRW-Liga; łącznie grup jest 11). W letniej przerwie z VfB Huel trenował okazjonalnie, dla podtrzymania formy po rozwiązaniu umowy z Schalke, były reprezentant Niemiec Gerald Asamoah. W drużynie narodowej RFN i Niemiec, w latach 1984-1998, Thon rozegrał 52 spotkania i strzelił trzy bramki. Jego największymi sukcesami były złoty (1990) i srebrny (1986; jako rezerwowy) medal MŚ oraz półfinał ME (1988).