Burghardt wyprzedził dwóch towarzyszy ucieczki. Peleton z liderem przyjechał do mety ze stratą 47 sekund do zwycięzcy. Na starcie etapu doszło do niecodziennej sytuacji - protestu trzech ekip (Cervelo, Caisse d'Epargne i AG2R) przeciwko... niesportowej postawie Brytyjczyka Marka Cavendisha. W środę na finiszu Cavendish spowodował kraksę, w której poważnie ucierpieli i musieli wycofać się z wyścigu Heinrich Haussler, Arnaud Coyot i Lloyd Mondory. W czwartek ich koledzy zablokowali na dwie minuty peleton, aby dać wyraz temu, że nie zgadzają się na niebezpieczny styl jazdy Brytyjczyka. Również sędziowie dopatrzyli się winy Cavendisha, karząc go dodaniem 30 sekund za zmianę toru jazdy, której efektem był kraksa. Wyniki 5. etapu, Wettingen - Frutigen (172,5 km): 1. Marcus Burghardt (Niemcy/BMC Racing) - 4:21:23 2. Martijn Maaskant (Holandia/Garmin) 2 s 3. Daniel Oss (Włochy/Liquigas) 4 4. Robbie McEwen (Australia/Katiusza) 47 5. Diego Ulissi (Włochy/Lampre) 6. Marco Marcato (Włochy/Vacansoleil) ten sam czas .. 107. Michał Gołaś (Polska/Vacansoleil) 9.16 klasyfikacja generalna: 1. Tony Martin (Niemcy/HTC-Columbia) - 18:57.47 2. Fabian Cancellara (Szwajcaria/Saxo Bank) 1 s 3. Thomas Loevkvist (Szwecja/Sky) 9 4. Rigoberto Uran (Kolumbia/Caisse d'Epargne) 10 5. Dries Devenyns (Belgia/Quick Step) 11 6. Steve Morabito (Szwajcaria/BMC Racing) 11 .. 98. Michał Gołaś (Polska/Vacansoleil) 22.34