W 2005 roku Peseiro doprowadził Sporting Lizbona do finału Ligi Europejskiej, w którym jego zespół musiał uznać wyższość CSKA Moskwa (1:3). - Braga jest jednym z czterech najlepszych klubów portugalskich. Naszym celem jest gra w Lidze Mistrzów - powiedział Peseiro. W 2011 roku klub ten w finale LE uległ FC Porto (0-1). W tym sezonie zespół ponownie występować będzie w Lidze Europejskiej, gdyż zajął trzecie miejsce w ekstraklasie portugalskiej.