Prokurator zarzuca mu, że w sposób niezgodny z prawem wykorzystał w 2008 roku środki przyznane związkowi przez Europejską Unię Piłkarską (UEFA). Grecja otrzymała od UEFA milion franków szwajcarskich na odbudowę obiektów, zniszczonych lub uszkodzonych przez pożary szalejące w południowej i środkowej części kraju w 2007 roku. Ze śledztwa wynika, że przeznaczyła te fundusze na wypłacenie dodatkowej nagrody selekcjonerowi męskiej reprezentacji Otto Rehhagelowi. Niemiec kierował drużyną narodową w latach 2001-10, a w 2004 roku zdobył z nią mistrzostwo Europy. Gagatsis pełni obecnie dyrektorskie stanowisko we władzach greckiej ekstraklasy.