Sezon zasadniczy z udziałem 13 ekip potrwa do 14 marca. Każdy z zespołów rozegra w tej fazie, systemem mecz i rewanż, 24 spotkania. Do play off awansuje osiem najlepszych zespołów. W pierwszej fazie play off (początek 18 marca) - ćwierćfinałach, walka toczyć się będzie do trzech zwycięstw, ale z zaliczeniem wyników z sezonu zasadniczego. Jeśli jedna z drużyn pokona ćwierćfinałowego przeciwnika dwukrotnie w sezonie zasadniczym, to w pierwszej rundzie play off rozegrać może tylko jeden mecz, który w przypadku zwycięstwa da jej awans do półfinałów mistrzostw Polski. W każdym zespole na parkiecie będą musiały przebywać w całym meczu dwie Polki, a w 12-osobowym składzie drużyny powinno być co najmniej sześć krajowych koszykarek, w tym dwie zawodniczki urodzone w 1985 roku lub młodsze. Poza tym nie ma żadnych limitów dla koszykarek zagranicznych - drugie sześć zawodniczek w składzie może pochodzić z jednego państwa np. USA. Atrakcje sezonu 2008/2009 to mecz o Superpuchar, który odbędzie się 27 września w Toruniu (godz. 19.15) pomiędzy mistrzem Polski Wisłą Can Pack Kraków a zdobywcą Pucharu Polski Lotosem Gdynia. 1 lutego 2009 roku odbędzie się natomiast najprawdopodobniej w Krakowie Mecz Gwiazd - Wisła Can Pack kontra Gwiazdy PLKK. O tym, czy zostanie podtrzymany przegłosowany w czerwcu zapis o tym, że ligę opuszczą dwie najsłabsze drużyny, zadecyduje rada nadzorcza PLKK podczas posiedzenia w dniu 20 września. Półfinały rozgrywane będą do trzech zwycięstw, a finał do czterech. Złote medale MP w 2008 roku wywalczyły koszykarki Wisły Can Pack Kraków, które w siedmiomeczowym thrillerze pokonały Lotos PKO BP Gdynia 4-3, wygrywając siódmy mecz w Gdyni po dogrywce.