Costa uciekł z peletonu wraz z Nibaldim. Obaj uzyskali w pewnym momencie minutę przewagi nad goniącą ich dwójką Hiszpanem Alejandro Valverde i Francuzem Tony Gallopinem. Na 300 m przed metą, w trudnych warunkach, przy padającym deszczu Costa zaatakował i zwyciężył z pięciosekundową przewagą nad Nibaldim. Trzeci na mecie był Valverde, a jego strata do zwycięzcy wyniosła 38 s. O sekundę później linię mety minął Gallopin. Peleton został zdziesiątkowany przez trudne warunki atmosferyczne. Na metę docierały małe grupki zawodników; w ostatniej, która straciła ponad pół godziny do triumfatora byli obaj Polacy. Paweł Poljański (Tinkoff-Saxo) został sklasyfikowany na 73. pozycji, a Bartosz Huzarski (Bora-Argon) na 116. Obaj stracili po 36.25. Impreza zakończy się w niedzielę. Wyniki szóstego etapu: 1. Rui Costa (Portugalia/Lampre) 4:29.23 2. Vincenzo Nibali (Włochy/Astana) strata 5 s 3. Alejandro Valverde (Hiszpania/Movistar) 38 4. Tony Gallopin (Francja/Lotto) 39 5. Simon Yates (W. Brytania/Orica) 1.24 6. Daniel Martin (Irlandia/Cannondale) 1.46 ... 73. Paweł Poljański (Polska/Tinkoff-Saxo) 36.25 116. Partosz Huzarski (Polska/Bora-Argon) 36.25 Klasyfikacja po sześciu etapach: 1. Vincenzo Nibali (Włochy/Astana) 22:34.17 2. Rui Costa (Portugalia/Lampre) strata 29 s 3. Alejandro Valverde (Hiszpania/Movistar) 30 4. Simon Yates (W. Brytania/Orica) 35 5. Tejay van Garderen (USA/BMC Racing) 42 6. Benat Intxausti (Hiszpania/Movistar) 57 ... 55. Paweł Poljański (Polska/Tinkoff-Saxo) 38.06 97. Partosz Huzarski (Polska/Bora-Argon) 54.22