Dorde Czotra piłkarską karierę rozpoczynał w jednym z najstarszych klubów serbskich - FK Kikinda (założonym w 1909 roku). Następnie grał dla drużyn z Belgradu: FK BSK Batajnica, FK BSK Borcza (61 występów w lidze, 3 gole). Defensor grał jeszcze przez sezon dla FK Vojvodina (11 meczów w lidze). Kolejne pół roku Czotra spędził w FK BSK Borča (11 meczów w lidze), później zaliczył epizod w FK Hajduk (Kula). Przez następne dwa i pół roku obrońca związany był z belgradzkim FK Rad (51 ligowych występów, 3 gole) - klubem, w którym pierwsze piłkarskie kroki stawiał były obrońca "Miedziowych" Sreten Sretenović. Przed startem rundy wiosennej 2010/2011 Dorde Czotra związał się z Polonią Warszawa. W barwach "Czarnych Koszul" defensor zagrał łącznie 34 ligowe spotkania, do swego dorobku dołożył pięć występów w Pucharze Polski