Autor 63 goli w 92 spotkaniach dla "Królewskich" był operowany przez światowej sławy chirurga, dra Richarda Steadmana. Jego powrót do gry odwlekano w obawie przed odnowieniem się urazu. Pojawiały się także głosy o możliwym odejściu Holendra z Estadio Santiago Bernabeu po dokonaniu przez klub wielu głośnych i kosztownych transferów, jednak sam piłkarz zadeklarował chęć pozostania w zespole i walkę o miejsce w składzie. Jak wynika z zapisu w kontrakcie, najbliższy sezon będzie ostatnim dla Van Nistelrooya w barwach Realu, chyba że działacze zaoferują mu po tym czasie nową umowę.